Expertise - CMGA

Met de verschillende onderzoeksgroepen en domeinen vormen we het excellentie consortium MEDGEN. Met deze samenwerking hebben we ons in de loop der jaren kunnen vormen tot een uitgebreid functionerend laboratorium en kennis centrum.

Onze onderzoekslaboratoria bestaan onder andere uit twee celcultuur laboratoriums, functioneel lab, zebravis faciliteit en is voorzien voor uitgebreide sequencing mogelijkheden.

We hebben ons in de loop der jaren gespecialiseerd in onder andere NGS, WGS, WES, RNA-seq, iPSC's, Zebravis onderzoek en CRISPR-Cas.

Naast de laboratoria hebben we ook een grote groep Bioinformatica gevormd.

NGS
Digital droplet PCR
Real-Time PCR
Covaris M2220
Leica Fluorescence Microscope
Bio-Informatica

Next-Generation Sequencing (NGS)
Het Centrum Medische Genetica Antwerpen beschikt over een modern Next-Generation Sequencing (NGS)-platform met jarenlange expertise in zowel onderzoeks- als diagnostische sequencingprojecten. Onze sequencingfaciliteit ondersteunt interne en externe onderzoekers met hoogwaardige sequencingdiensten en technisch advies.
Ons instrumentenpark omvat twee Illumina MiSeq, twee Illumina NextSeq-systemen en sinds kort een Element AVITI24. In de nabije toekomst wordt onze capaciteit verder uitgebreid met een tweede AVITI24-platform, waardoor we nog meer flexibiliteit, capaciteit en snelle doorlooptijden kunnen bieden.
Ons NGS-team heeft ruime ervaring met een breed scala aan library preparation-workflows, waaronder:
- Targeted sequencing
- Whole Exome Sequencing (WES)
- Whole Genome Sequencing (WGS)
- RNA sequencing (RNA-Seq)
- Amplicon sequencing
- 16S sequencing
- Custom NGS-oplossingen
Naast sequencing ondersteunen wij onderzoekers ook bij de keuze van de meest geschikte workflow, kwaliteitscontrole en de praktische uitvoering van hun project.
Heeft u interesse in onze NGS-faciliteiten of wenst u meer informatie? Neem gerust contact op via NGS@uantwerpen.be
Digital Droplet PCR (ddPCR)
The Centre for Medical Genetics Antwerp has extensive expertise in digital droplet PCR (ddPCR), a highly sensitive and precise technology for the detection and absolute quantification of nucleic acid targets.
ddPCR enables accurate quantification without the need for standard curves and is particularly suitable for applications such as rare variant detection, copy number variation (CNV) analysis, mutation analysis and monitoring of specific genetic changes.
Our expertise includes assay development, optimization and performing ddPCR analyses for both internal and external research groups.
For more information or collaboration opportunities, please contact our team.
Real-Time PCR
The Centre for Medical Genetics Antwerp has extensive expertise in Real-Time PCR (qPCR) technology for sensitive detection and quantification of DNA and RNA targets.
Our facility is equipped with the CFX96 Touch Deep Well Real-Time PCR Detection System from Bio-Rad, a flexible and high-performance platform enabling reliable and reproducible qPCR analyses.
Real-Time PCR is used for a broad range of applications, including gene expression analysis, validation of NGS results, mutation analysis, nucleic acid quantification, and the development and optimization of targeted assays.
With expertise in assay development, optimization and quality control, we support both internal and external research groups in a wide range of PCR-based projects.
For more information about our Real-Time PCR facilities or collaboration opportunities, please contact our team.
Covaris M220
Het Centrum Medische Genetica Antwerpen beschikt over een Covaris M220-systeem voor nauwkeurige en reproduceerbare fragmentatie van DNA- en RNA-materiaal.
Deze technologie wordt gebruikt als belangrijke voorbereidende stap voor verschillende NGS-toepassingen, waaronder Whole Exome Sequencing (WES), Whole Genome Sequencing (WGS) en andere sequencing-workflows.
Door gebruik te maken van gecontroleerde akoestische fragmentatie kunnen optimale bibliotheekpreparaties worden bekomen voor hoogwaardige sequencingresultaten.
Leica Fluorescence Microscope
Onze faciliteit beschikt over een Leica fluorescentiemicroscoop voor geavanceerde microscopische analyse van fluorescente signalen in biologische stalen.
Deze technologie ondersteunt verschillende onderzoeksprojecten waarbij visualisatie en analyse van specifieke cellulaire structuren, eiwitexpressie of genetische markers noodzakelijk zijn.
Onze expertise omvat beeldvorming, analyse en ondersteuning bij experimentele toepassingen binnen de genetica en moleculaire biologie.
Bio-Informatica
Het Centrum Medische Genetica Antwerpen beschikt over een gespecialiseerd bio-informatica team dat ondersteuning biedt bij de verwerking, analyse en interpretatie van complexe genetische datasets.
Onze expertise omvat onder andere de analyse van NGS-data afkomstig van Whole Exome Sequencing (WES), Whole Genome Sequencing (WGS), RNA sequencing en targeted sequencing.
Wij ondersteunen onderzoekers bij data-analyse, kwaliteitscontrole, variantdetectie, interpretatie en het ontwikkelen van aangepaste bio-informatica workflows.
https://www.biomina.be/